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도움말 · 빠른 시작

5단계면
첫 분석 결과까지.

실제 BioSpark 화면의 번호와 옆 설명을 연결했습니다. 번호 순서대로 따라가며 입력과 준비 상태를 확인하세요.

약 3분 분량Germline · Somatic 공통

어떤 데이터로 시작하나요?

데모 데이터로 바로 체험추천업로드 없이 · 입력 데이터 Ready Data02부터 →내 FASTQ로 분석업로드 후 · 입력 데이터 My Data01부터 →

데모도 프로젝트 권한과 분석 검증을 거칩니다. 시작 전 화면의 실행 조건을 확인하세요.

FASTQ 업로드

데이터 → 내 데이터 · 데모 데이터라면 건너뛰기

biospark.co.kr/workflow.html#my-data
내 데이터와 FASTQ 쌍
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  1. 1. 파일 업로드

    파일 업로드를 누르세요. 폴더째 올리려면 Upload Folder를 선택합니다.

  2. 2. R1·R2를 함께

    같은 샘플의 R1·R2 FASTQ를 올립니다. 목록에 보인 뒤에도 업로드·준비 상태를 확인하세요.

  3. 3. FASTQ 쌍 확인

    FASTQ 쌍 탭에서 같은 샘플로 묶였는지 확인합니다. 분석에는 서버가 허용한 Ready 입력이 필요합니다.

Somatic이라면 Tumor R1·R2와 Normal R1·R2, 총 4개 파일을 준비합니다.

새 분석 시작

분석 화면에서 Germline / Somatic을 고르면 설정 창이 열립니다

biospark.co.kr/dashboard.html
Germline과 Somatic 분석 시작
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BioSpark · 새 분석
새 분석 이름·프로젝트·R1 선택
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  1. 1. Germline 시작

    Somatic은 옆 카드의 Somatic 시작을 선택합니다.

  2. 2. 결과 이름

    영문·숫자로 시작하는 1–64자. 이후 점·대시·밑줄도 사용할 수 있습니다.

  3. 3. 프로젝트

    분석 가능으로 표시된 프로젝트를 선택합니다. 조회 전용 프로젝트에서는 실행할 수 없습니다.

  4. 4. 입력 데이터

    데모는 Ready Data, 내 업로드 파일은 My Data에서 선택합니다. 사용 가능한 목록은 권한과 준비 상태에 따라 달라집니다.

  5. 5. R1 FASTQ 선택

    원하는 샘플의 R1을 선택하세요. 화면의 예시 이름과 실제 목록의 이름은 다를 수 있습니다.

검증 후 시작

입력과 설정을 확인하고, 검증을 통과한 뒤 직접 시작합니다

BioSpark · 입력 데이터
R2 선택과 입력 확인·설정 검증
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  1. 1. R2 선택 후 확인 체크

    같은 샘플의 R2를 고르고 read 방향과 샘플 역할 확인 항목을 체크합니다.

  2. 2. Validate Settings

    설정 검증을 누르고 하단 안내를 확인합니다.

BioSpark · 분석 준비 완료
분석 준비 완료와 Start Analysis
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  1. 3. 분석 준비 완료 확인

    검증 통과와 입력·프로젝트의 실행 가능 상태를 확인합니다.

  2. 4. Start Analysis

    활성화된 Start Analysis를 눌러 분석을 시작합니다.

BioSpark · 요청 완료
제출된 분석과 실행 이력 이동
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  1. i. 분석 설정 확인

    화면 예시는 Full Analysis · Annotated VCF · BioSpark Managed (CPU)입니다. 실제 선택 모드를 확인하세요.

  2. 5. View Run History

    SUBMITTED 안내가 나오면 실행 이력으로 이동합니다.

컴퓨트 옵션: Germline Speed Mode (GPU)는 출력과 보고서 구성이 CPU 모드와 다릅니다. 처음이라면 현재 권장 설정과 안내되는 비용·출력을 확인하세요.

진행 확인

실행 이력에서 상태 확인 · 제출된 분석은 창을 닫아도 계속됩니다

biospark.co.kr/dashboard.html · 실행 이력
실행 이력과 분석 상태
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  1. 1. Refresh

    실행 이력 오른쪽 위 Refresh로 최신 상태를 불러옵니다.

  2. 2. 진행 중

    Starting · Running 등 현재 상태를 확인합니다. 대기·준비 시간은 실행마다 다릅니다.

  3. 3. Completed 행 열기

    완료된 실행의 이름을 누르면 Run Details가 열립니다.

소요 시간은 입력 크기·분석 모드·대기 상태에 따라 달라집니다. 화면 예시의 시간은 완료 시간 보장이 아닙니다.

결과 확인

Results 또는 실행 이력 → Run Details에서 생성된 결과를 확인합니다

BioSpark · 실행 상세
Run Details 결과 버튼 다섯 개
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  1. 1. FASTQC 리포트

    생성된 경우 R1·R2 read 품질을 확인합니다.

  2. 2. 분석 결과 리포트

    선택한 분석 모드의 결과 리포트를 엽니다.

  3. 3. MultiQC 리포트

    사용 가능한 경우 QC 종합 리포트를 새 탭에서 확인합니다.

  4. 4. Variant Lake 열기

    해당 실행에서 사용 가능한 genotyped VCF 변이를 검색합니다. gVCF만 있는 모드에서는 사용할 수 없습니다.

  5. 5. 결과 파일 보기

    실제로 생성된 파일 목록에서 Download를 선택합니다.

보고서·결과 파일 버튼은 생성 여부와 결과 준비 상태에 따라 비활성화될 수 있습니다. VCF/gVCF/annotated VCF 및 BAM·QC 파일 구성은 분석 모드마다 다릅니다.

결과 파일 다운로드

BioSpark · 결과 파일
실행별 결과 파일과 Download
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화면은 Annotated VCF 예시입니다. 선택한 출력 모드의 주요 파일과 인덱스를 확인하고 파일별 Download를 누르세요.

MultiQC 리포트

BioSpark · MultiQC
MultiQC 품질 요약 리포트
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목차에서 해당 리포트가 제공하는 General Statistics · Annotated VCF Summary · FastQC 항목을 확인합니다.

Variant Lake 변이 검색

BioSpark · Variant Lake
Variant Lake 검색 화면 예시
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지원되는 실행에서 Gene · 염색체 · 위치 · 타입 조건으로 Search Variants를 사용합니다. 제공 항목과 접근 권한을 확인하세요.

막혔나요?

가장 자주 묻는 다섯 가지입니다.

Validate Settings / Start Analysis가 눌리지 않아요

하단 안내를 확인하세요. 결과 이름 규칙, 분석 가능한 프로젝트, 허용된 R1·R2 입력과 확인 체크가 필요합니다. 검증을 통과한 뒤 Start Analysis가 활성화됩니다.

내 파일이 R1/R2 목록에 없어요

내 업로드 파일은 My Data에서 찾으세요. 내 데이터의 업로드·준비 상태와 FASTQ 쌍을 확인하고, 현재 프로젝트에서 사용할 수 있는 파일인지 확인합니다.

프로젝트를 고를 수 없어요

분석 가능한 프로젝트에서만 실행할 수 있습니다. 조회 전용이라면 관리자에게 필요한 권한을 요청하세요.

상태가 Starting에서 바뀌지 않아요

실행 이력의 Refresh로 최신 상태를 확인하세요. 준비·대기 시간은 다를 수 있습니다. 오류가 표시되면 실행 ID와 오류 문구를 지원팀에 알려 주세요.

VCF 파일은 어디서 받나요?

완료된 실행 → Run Details → 결과 파일 보기로 이동합니다. 분석 모드에 따라 생성된 VCF, gVCF 또는 annotated VCF와 인덱스 등 실제 목록의 파일을 내려받으세요.

지금 데모 데이터로 시작해 보세요.

로그인 → 분석 → Germline 시작 → 사용 가능한 Ready Data 선택

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